1977-1981年是卢嘉锡在物构所大展宏图的时期。他根据二十世纪八十年代国际结构化学的最新动态，对所内人员配备、科研布局和科研方向做了重大的调整和重建，推动形成了规模较大、权责一致、协同高效的攻关团队，为物构所在结构化学和晶体材料两个主要研究领域的成长壮大打下坚实的基础。在调整中，卢嘉锡强调研究力量相对集中、扬长避短、合理布局、逐步形成特色，开始实行研究所、研究室、课题组的三级管理体制，并于1979年6月成立了研究所学术委员会，卢嘉锡亲自担任学术委员会主任。同年12月，他荣获全国和福建省劳动模范称号。

1979年12月，卢嘉锡因在科研方面的重大贡献荣获全国劳动模范称号