分子动力学模拟LAMMPS(初级培训班第七期)通知
时间:2017年11月17日-19日 地点:北京化工大学(东校区)
8:00-11:30 注册报到,领取资料
作为科学研究手段的分子模拟:历史与展望 ;
分子模拟的优势和局限;
分子模拟的基本框架:建模(前处理)/采样(模拟)/分析(后处理);
13:30-17:00 LAMMPS分子动力学理论基础
MD基本原理:运动方程/边界/截断/长程作用/系综...
模拟数据分析基础:微观结构/热力学性质/时间相关函数
分子力场参数优化举例
lammps的编译/linux基础/任务提交/
第二天
8:30-11:30 LAMMPS上机实战 1
用LAMMPS操作完成Lennard-Jones melt,crack两个问题的分子动力学模拟,并将结果利用VMD、VOITO软件进行可视化。
学员在此阶段可以学习LAMMPSin文件的编写及可视化软件VMD、OVITO的使用,制作精美图片、动画。通过联系,学员亲自上机实践,加深对lammps关键命令的理解。
13:30-17:00 LAMMPS上机实战 2
学习data文件的结构以及编写方法和注意事项,学习用VMD、packmol、Moltemplate、MS软件、topotool命令来建立涉及水、碳管、石墨烯、高分子链、复合系统等的初始构型,并导出lammps能用的data文件的方法。
通过具体的练习,亲自操作,加深学员对于这些软件、方法的掌握。
第三天
8:30-11:30 LAMMPS上机实战 3
利用LAMMPS完成melt, crack问题的研究,并分析模拟所得结果。运用lammps对系统施加不同力学载荷、模拟磁场、电场以及控温、控压等操作的实现;学习用lammps输出分析所需要的系统不同层次的信息的方法;
进一步讲解VMD、OVITO在模拟结果分析中的作用。通过具体的练习来加深学员对LAMMPS施加不同载荷的命令的理解。
13:30-17:00 LAMMPS上机实战 4
全原子分子动力学模拟、粗粒化分子动力学模拟实例讲解。通过多个实例的演示学习,加强学员对LAMMPS模拟中主要文件的编写、系统平衡、时间步长选择、出错调试等等一系列重要问题的认识。
答疑解惑,互动讨论。
报名费用:注册费:老师(2300元/人);学生(1800元/人),同一单位2人或以上参加可享受每人优惠300元(含听课费、资料费、午餐,不包括住宿费用,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
联系方式: 刘老师,010-67506231,liuhuanhuan@gainstrong.net
报名方式: 请编辑信息:单位+姓名+职称+邮箱+电话 发送邮件到 info@gainstrong.net